本文
天然記念物【分類別】
動物
軟体動物類
【県】金生山の陸貝と生息地[きんしょうざんのりくがいとせいそくち]（大垣市）
昆虫類
【県】門和佐川のゲンジボタル[かどわさがわのげんじぼたる]（下呂市）
【県】ハッチョウトンボ群棲地[はっちょうとんぼぐんせいち]（八百津町）
【県】ヒメハルゼミ生息地[ひめはるぜみせいそくち]（揖斐川町谷汲）
魚類
【国】粥川ウナギ生息地[かゆかわうなぎせいそくち]（郡上市美並町）
【国】津屋川水系清水池のハリヨ生息地（海津市南濃町）
【県】ハリヨ生息地[はりよせいそくち]（大垣市）
【県】池田町八幡のハリヨ繁殖地[いけだちょうやわたのはりよはんしょくち]（池田町）
両生類
【国】オオサンショウウオ生息地[おおさんしょううおせいそくち]（和良川）（郡上市和良町、八幡町）
【国】オオサンショウウオ生息地[おおさんしょううおせいそくち]（小間見川）（郡上市大和町）
【県】モリアオガエル群生地[もりあおがえるぐんせいち]（垂井町）
【県】モリアオガエル群生地[もりあおがえるぐんせいち]（郡上市八幡町）
鳥類
【国】洲原神社ブッポウソウ繁殖地[すはらじんじゃぶっぽうそうはんしょくち]（美濃市）
【県】高山城跡[たかやまじょうあと]（史跡、天然記念物）（高山市）
植物
地衣類
【県】紅岩[べにいわ]（中津川市蛭川）
コケ類
【県】笠置山のヒカリゴケ[かさぎやまのひかりごけ]（恵那市中野方町）
シダ類
【県】くらがりシダ[くらがりしだ]（下呂市小坂町）
裸子植物類
イチョウ科
《イチョウ属》
【国】飛騨国分寺の大イチョウ[ひだこくぶんじのおおいちょう]（高山市）
【県】加茂のイチョウ[かものいちょう]（高山市国府町）
【県】藤九郎ギンナン[とうくろうぎんなん]（瑞穂市）
【県】長楽寺のイチョウ[ちょうらくじのいちょう]（中津川市阿木）
イチイ科
《イチイ属》
【国】治郎兵衛のイチイ[じろべいのいちい]（高山市荘川町）
【県】土のイチイ[どのいちい]（飛騨市神岡町）
【県】向善寺のイチイ[こうぜんじのいちい]（飛騨市古川町）
【県】牧ヶ洞のイチイ[まきがほらのいちい]（高山市清見町）
【県】馬頭観音のイチイ[ばとうかんのんのいちい]（下呂市萩原町）
【県】位山八幡宮のイチイ[くらいやまはちまんぐうのいちい]（下呂市萩原町）
【県】明善寺のイチイ[みょうぜんじのいちい]（白川村）
【県】下田のイチイ[しもだのいちい]（白川村）
【県】大谷のイチイ[おおたにのいちい]（飛騨市河合町）
【県】野平家のイチイ防風林[のひらけのいちいぼうふうりん]（高山市荘川町）
【県】桂林寺のイチイ[けいりんじのいちい]（下呂市馬瀬）
《カヤ属》
【県】大実カヤの木[おおみかやのき]（中津川市苗木）
【県】瀬戸のカヤ[せとのかや]（中津川市苗木）
【県】了因寺のカヤ[りょういんじのかや]（高山市清見町）
【県】河合のカヤ[かわいのかや]（恵那市笠置町）
【県】正家のカヤ[しょうげのかや]（恵那市長島町）
【県】唯願寺のしぶなしガヤ[ゆいがんじのしぶなしがや]（大垣市上石津町）
マツ科
《マツ属》
【県】大船神社参道の松並木[おおぶねじんじゃさんどうのまつなみき]（恵那市上矢作町）
《モミ属》
【国】垂洞のシダレモミ[たるぼらのしだれもみ]（中津川市付知町）
スギ科
《スギ属》
【国特別天然記念物】石徹白のスギ[いとしろのすぎ]（郡上市白鳥町）
【国】加子母のスギ[かしものすぎ]（中津川市加子母）
【国】久津八幡神社の夫婦スギ[くづはちまんじんじゃのめおとすぎ]（下呂市萩原町）
【国】禅昌寺の大スギ[ぜんしょうじのおおすぎ]（下呂市萩原町）
【国】千光寺の五本スギ[せんこうじのごほんすぎ]（高山市丹生川町）
【国】神淵神社の大スギ[かぶちじんじゃのおおすぎ]（七宗町）
【国】神ノ御杖スギ[かみのおつえすぎ]（郡上市美並町）
【国】大山の大スギ[おおやまのおおすぎ]（白川町）
【県】日枝神社の大スギ[ひえじんじゃのおおすぎ]（高山市）
【県】高山神明神社の大スギ[たかやましんめいじんじゃのおおすぎ]（高山市）
【県】大湫神明神社の大杉[おおくてしんめいじんじゃのおおすぎ]（瑞浪市大湫町）
【県】高山白山神社の矢立スギ[たかやまはくさんじんじゃのやたてすぎ]（高山市）
【県】宮谷神明神社の夫婦スギ[みやたにしんめいじんじゃのめおとすぎ]（下呂市萩原町）
【県】団子スギ[だんごすぎ]（恵那市明智町）
【県】大船神社の弁慶スギ[おおぶねじんじゃのべんけいすぎ]（恵那市上矢作町）
【県】六厩の夫婦スギ[むまやのめおとすぎ]（高山市荘川町）
【県】武芸八幡神社のスギ[むげはちまんじんじゃのすぎ]（関市武芸川町）
【県】常蓮寺のスギ[じょうれんじのすぎ]（飛騨市神岡町）
【県】水無神社の大スギ[みなしじんじゃのおおすぎ]（高山市一之宮）
【県】伊野一本スギ[いのいっぽんすぎ]（揖斐川町谷汲）
【県】磯前神社のスギ[いそさきじんじゃのすぎ]（中津川市坂下）
【県】白山神社のスギ[はくさんじんじゃのすぎ]（郡上市白鳥町）
【県】恵那神社の夫婦スギ[えなじんじゃのめおとすぎ]（中津川市中津）
【県】里宮佐久良太神社のスギ[さとみやさくらたじんじゃのすぎ]（白川町）
【県】大森神社の大スギ[おおもりじんじゃのおおすぎ]（白川町）
【県】弥栄スギ（一名れんげスギ）[やさかすぎ（いちめいれんげすぎ）]（飛騨市宮川町）
【県】白山神社のスギ[はくさんじんじゃのすぎ]（岐阜市）
【県】和川白山神社のスギ[わがわはくさんじんじゃのすぎ]（下呂市）
【県】神代スギ[じんだいすぎ]（高山市清見町）
【県】洞の五本スギ[ほらのごほんすぎ]（下呂市萩原町）
【県】県神社のスギ[あがたじんじゃのすぎ]（下呂市萩原町）
【県】白山神社のスギ[はくさんじんじゃのすぎ]（揖斐川町）
【県】熊野神社のスギ[くまのじんじゃのすぎ]（高山市）
【県】芦倉八幡神社のスギ[あしくらはちまんじんじゃのすぎ]（白川村）
【県】石徹白の浄安スギ[いとしろのじょうあんすぎ]（郡上市白鳥町）
【県】湯葉神社のスギ[ゆばじんじゃのすぎ]（大垣市）
【県】伊富岐神社の大スギ[いぶきじんじゃのおおすぎ]（垂井町）
【県】若宮八幡神社スギとトチノキの双生樹[わかみやはちまんじんじゃすぎととちのきのそうせいじゅ]（飛騨市宮川町）
【県】若宮八幡神社三本スギ[わかみやはちまんじんじゃさんぼんすぎ]（飛騨市宮川町）
【県】槻本神社のスギ[つきもとじんじゃのすぎ]（高山市丹生川町）
【県】戸隠神社の一本スギ[とがくしじんじゃのいっぽんすぎ]（郡上市和良町）
ヒノキ科
《クロベ属》
【県】クロベの大樹[くろべのたいじゅ]（高山市丹生川町）
《ヒノキ属》
【県】大智寺の大ヒノキ[だいちじのおおひのき]（岐阜市）
【県】坂下の十二本ヒノキ[さこれのじゅうにほんひのき]（下呂市小坂町）
【県】白山神社の六本ヒノキ[はくさんじんじゃのろっぽんひのき]（郡上市大和町）
【県】七本サワラ[ななほんさわら]（高山市朝日町）
被子植物類
ブナ科
《クリ属》
【国】竹原のシダレグリ自生地[たけはらのしだれぐりじせいち]（下呂市）
【県】二つ葉グリ[ふたつばぐり]（高山市清見町）
【県】大洞のクリ[おおぼらのくり]（下呂市小坂町）
【県】銚子ヶ渕のクリ[ちょうしがふちのくり]（郡上市白鳥町）
《シイノキ属》
【県】関ヶ原本陣スダジイ[せきがはらほんじんすだじい]（関ケ原町）
《ブナ属》
【県】白山中居神社のブナ原生林[はくさんちゅうきょじんじゃのぶなげんせいりん]（郡上市白鳥町）
《コナラ属》
【県】薬研洞の大ナラ[やけんぼらのおおなら]（白川町）
【県】稲荷神社のイチイガシ[いなりじんじゃのいちいがし]（揖斐川町）
【県】秋葉神社のイチイガシ[あきばじんじゃのいちいがし]（揖斐川町）
【県】熊野神社のアラカシ[くまのじんじゃのあらかし]（揖斐川町春日）
ニレ科
《ムクノキ属》
【県】新宮塚のムクノキ[しんぐうづかのむくのき]（揖斐川町）
【県】西蓮寺のムクノキ[さいれんじのむくのき]（揖斐川町）
【県】川合のムクノキ[かわいのむくのき]（美濃加茂市）
【県】六社神社のムクノキ[ろくしゃじんじゃのむくのき]（養老町）
《ケヤキ属》
【県】住吉神社のケヤキ[すみよしじんじゃのけやき]（高山市丹生川町）
【県】二之宮神社のケヤキ[にのみやじんじゃのけやき]（高山市）
【県】坂下のケヤキ[さこれのけやき]（下呂市小坂町）
【県】春日中山のケヤキ[かすがなかやまのけやき]（揖斐川町春日）
【県】杉生神社のケヤキ[けやき]（海津市南濃町）
カツラ科
《カツラ属》
【県】千本カツラ[せんぼんかつら]（高山市高根町）
【県】洞のカツラ[ほらのかつら]（飛騨市宮川町）
【県】菅沼のカツラ[すがぬまのかつら]（飛騨市宮川町）
モクレン科
《モクレン属》
【県】栗原神社のコブシ[くりはらじんじゃのこぶし]（飛騨市河合町）
【県】岩谷堂のシデコブシ群生地［いわやどうのしでこぶしぐんせいち］（中津川市坂本）
【県】池本のフクロホウバ[いけもとのふくろほうば]（高山市清見町）
クスノキ科
《ニッケイ属》
【県】松山諏訪神社の大クス[まつやますわじんじゃのおおくす]（海津市南濃町）
バラ科
《サクラ属》
【国】根尾谷淡墨ザクラ[ねおだにうすずみざくら]（本巣市根尾）
【国】揖斐二度ザクラ[いびにどざくら]（大野町）
【国】霞間ヶ渓（サクラ）[かまがたに（さくら）]（名勝及び天然記念物）（池田町）
【国】中将姫誓願ザクラ[ちゅうじょうひめせいがんざくら]（岐阜市）
【国】臥竜のサクラ[がりゅうのさくら]（高山市一之宮町）
【県】鎮護ザクラ[ちんござくら]（飛騨市古川町）
【県】荘川ザクラ[しょうかわざくら]（高山市荘川町）
【県】藤路のサクラ[ふじろのさくら]（郡上市白鳥町）
【県】水戸野のシダレザクラ[みどののしだれざくら]（白川町）
【県】甘南美寺のサクラ[かんなみじのさくら]（山県市）
【県】苗代ザクラ[なわしろざくら]（下呂市）
【県】枝垂れザクラ[しだれざくら]（高山市清見町）
【県】羽根白山のサクラ[はねしろやまのさくら]（下呂市萩原町）
【県】サクラ[さくら]（下呂市小坂町）
【県】落合のサクラ[おちあいのさくら]（下呂市小坂町）
【県】立石のサクラ[たていしのさくら]（下呂市小坂町）
【県】おおたザクラ[おおたざくら]（白川村）
【県】善勝寺のサクラ[ぜんしょうじのさくら]（郡上市白鳥町）
【県】山ノ上のサクラ[やまのうえのさくら]（美濃加茂市）
【県】春日神明神社彼岸ザクラ[かすがしんめいじんじゃひがんざくら]（郡上市八幡町）
【県】ひよもの枝垂れザクラ[ひよものしだれざくら]（恵那市串原）
【県】わさざのサクラ[わさざのさくら]（下呂市馬瀬）
【県】聖蓮寺の八房ウメ[しょうれんじのやつふさうめ]（関ケ原町）
【県】長瀬のウメ[ながせのうめ]（下呂市小坂町）
《リンゴ属》
【県】古城山のオオウラジロノキ[こじょうざんのおおうらじろのき]（地方名ヤマナシ）（可児市）
マメ科
《フジ属》
【県】藤ヶ森観音堂のフジ[ふじがもりかんのんどうのふじ]（下呂市萩原町）
【県】春日神社のフジ社叢[かすがじんじゃのふじしゃそう]（高山市清見町）
【県】竹鼻別院のフジ[たけはなべついんのふじ]（羽島市）
【県】臥竜のフジ[がりゅうのふじ]（下呂市萩原町）
モチノキ科
《モチノキ属》
【県】朝日神社のクロガネモチ[あさひじんじゃのくろがねもち]（北方町）
カエデ科
《カエデ属》
【国】楓谷のヤマモミジ樹林[かえでだにのやまもみじじゅりん]（美濃市）
【県】領家のモミジ[りょうけのもみじ]（郡上市大和町）
【国】坂本のハナノキ自生地[さかもとのはなのきじせいち]（中津川市坂本）
【国】釜戸ハナノキ自生地[かまとはなのきじせいち]（瑞浪市釜戸町）
【国】越原ハナノキ自生地[おっぱらはなのきじせいち]（東白川村）
【国】富田ハナノキ自生地[とみだはなのきじせいち]（恵那市岩村町）
【国】白山神社のハナノキ及びヒトツバタゴ[はくさんじんじゃのはなのきおよびひとつばたご]（土岐市）
【県】亀ヶ沢のハナノキ自生地[かめがさわのはなのきじせいち]（恵那市三郷町）
【県】遠見場のハナノキ[とんばのはなのき]（白川町）
【県】ハナノキ自生地[はなのきじせいち]（中津川市蛭川）
【県】坂下のハナノキ群生地[さかしたのはなのきぐんせいうち]（中津川市坂下）
モクセイ科
《トネリコ属》
【県】名無木[ななしぎ]
《モクセイ属》
【県】国恩寺のヒイラギ[こくおんじのひいらぎ]（本巣市）
《ヒトツバタゴ属》
【国】ヒトツバタゴ自生地[ひとつばたごじせいち]（中津川市蛭川・瑞浪市釜戸町・恵那市笠置町・愛知県犬山市）
【国】白山神社のハナノキ及びヒトツバタゴ[はくさんじんじゃのはなのきおよびひとつばたご]（土岐市）
【県】自生のヒトツバタゴ[じせいのひとつばたご]（中津川市苗木）
【県】自生のヒトツバタゴ[じせいのひとつばたご]（恵那市明智町）
【県】大湫ヒトツバタゴ自生地[おおくてひとつばたごじせいち]（瑞浪市大湫町）
【県】大井ヒトツバタゴ[おおいひとつばたご]（恵那市大井町）
【県】中野方のヒトツバタゴ自生地[なかのほうのひとつばたごじせいち]（恵那市中野方町）
【県】新茶屋の自生ヒトツバタゴ[しんちゃやのじせいひとつばたご]（中津川市落合）
トチノキ科
《トチノキ属》
【県】白山神社のトチノキ[はくさんじんじゃのとちのき]（飛騨市河合町）
【県】落合のトチノキ[おちあいのとちのき]（下呂市小坂町）
【県】稗田のトチ[ひえだのとち]（白川村）
【県】臼坂のトチノキ[うっさかのとちのき]（飛騨市河合町）
【県】若宮八幡神社スギとトチノキの双生樹[わかみやはちまんじんじゃすぎととちのきのそうせいじゅ]（飛騨市宮川町）
【県】前谷床並社跡のトチノキ[まえだにとこなめしゃあとのとちのき]（郡上市白鳥町）
ツバキ科
《サカキ属》
【県】栗原連理のサカキ[くりはられんりのさかき]（垂井町）
ミズキ科
《サンシュユ属》
【県】一之瀬のサンシュユ[いちのせのさんしゅゆ]（大垣市上石津町）
ツツジ科
《ツツジ属》
【国】一之瀬のホンシャクナゲ群落[いちのせのほんしゃくなげぐんらく]（大垣市上石津町）
【県】白川町のシャクナゲ群落[しらかわちょうのしゃくなげぐんらく]（白川町）
【県】ヒカゲツツジ群落[ひかげつつじぐんらく]（郡上市八幡町）
【県】スズラン、レンゲツツジ群落[すずらん、れんげつつじぐんらく]（高山市朝日町）
【県】子の原高原レンゲツツジ群落[ねのはらこうげんれんげつつじぐんらく]（高山市高根町）
カキノキ科
《カキノキ属》
【県】廿原のカキ[つづはらのかき]（多治見市）
【県】宗祗ガキ[そうぎがき]（郡上市八幡町）
【県】宮村のカキ[みやむらのかき]（高山市一之宮町）
【県】しだれガキ[しだれがき]（中津川市蛭川）
サクライソウ科
《サクライソウ属》
【国】久々利のサクライソウ自生地[くくりのさくらいそうじせいち]（可児市）
サトイモ科
《ミズバショウ属》
【県】山中峠のミズバショウ群落[やまなかとうげのみずばしょうぐんらく]（高山市荘川町）
【県】大踏山のミズバショウ群生地[おおぐつやまのみずばしょうぐんせいち]（郡上市白鳥町）
【県】洞のミズバショウ､リュウキンカ群生地[ほらのみずばしょう、りゅうきんかぐんせいち]（飛騨市宮川町）
キンポウゲ科
《リュウキンカ属》
【県】洞のミズバショウ､リュウキンカ群生地[ほらのみずばしょう、りゅうきんかぐんせいち]（飛騨市宮川町）
《フクジュソウ属》
【県】稲越のフクジュソウ群生地[いなごえのふくじゅそうぐんせいち]（稲越菅野）（飛騨市河合町）
【県】フクジュソウ群落[ふくじゅそうぐんらく]（高山市朝日町）
【県】上ヶ島のフクジュソウ群生地[じょうがしまのふくじゅそうぐんせいち]（飛騨市河合町）
【県】稲越のフクジュソウ群生地[いなごえのふくじゅそうぐんせいち]（稲越沢黒）（飛騨市河合町）
ラン科
《マツラン属》
【県】坂下のモミラン[さかしたのもみらん]（中津川市坂下）
キジカクシ科
《スズラン属》
【県】スズラン、レンゲツツジ群落[すずらん、れんげつつじぐんらく]（高山市朝日町）
イネ科
《ヤダケ属》
【県】土岐双生竹[ときそうせいちく]（瑞浪市土岐町）
【県】武並のソウセイチク自生地[たけなみのそうせいちくじせいち]（恵那市武並町）
植物群落
《湿原植物》
【県】天生の高層湿原植物群落[あもうのこうそうしつげんしょくぶつぐんらく]（飛騨市河合町）
【県】蛭ケ野高層湿原植物群落[ひるがのこうそうしつげんしょくぶつぐんらく]（郡上市高鷲町）
《暖地性植物》
【県】鶴形山暖地性植物[つるがたやまだんちせいしょくぶつ]（美濃市）
社叢
【国】一位森八幡神社社叢[いちいのもりはちまんじんじゃしゃそう]（高山市高根町）
【県】白鳥神社の森[しろとりじんじゃのもり]（郡上市白鳥町）
【県】白山中居神社の森[はくさんちゅうきょじんじゃのもり]（郡上市白鳥町）
【県】津島神社社叢[つしまじんじゃしゃそう]（飛騨市神岡町）
【県】那比新宮神社社叢[なびしんぐうじんじゃしゃそう]（郡上市八幡町）
【県】春日神社のフジ社叢[かすがじんじゃのふじしゃそう]（高山市清見町）
【県】洲原神社社叢[すはらじんじゃしゃそう]（美濃市）
【県】八幡神社社叢[はちまんじんじゃしゃそう]（関市上之保）
【県】祖師野八幡神社の社叢[そしのはちまんじんじゃのしゃそう]（下呂市金山町）
【県】森茂白山神社社叢[もりもはくさんじんじゃしゃそう]（高山市清見町）
【県】長瀬神明神社社叢[ながせしんめいじんじゃしゃそう]（白川村）
【県】大船神社社叢[おおふねじんじゃしゃそう]（八百津町）
【県】大神神社の社叢[おおみわじんじゃのしゃそう]（大垣市上石津町）
【県】老杉神社の社叢[おいすぎじんじゃのしゃそう]（大垣市上石津町）
【県】中山六社神社社叢[なかやまろくしゃじんじゃしゃそう]（揖斐川町春日）
【県】明建神社社叢[みょうけんじんじゃしゃそう]（郡上市大和町）
【県】梶屋八幡神社社叢[かじやはちまんじんじゃしゃそう]（海津市海津町）
【県】中山神社社叢[なかやまじんじゃしゃそう]（恵那市串原）
【県】戸隠神社社叢[とがくしじんじゃしゃそう]（郡上市和良町）
【県】赤沼田神明の杜[あかんたしんめいのもり]（下呂市小坂町）
【県】上山口の諏訪神社社叢［かみやまぐちのすわじんじゃしゃそう］（中津川市山口）
地質鉱物
岩石・鉱物
【国特別天然記念物】根尾谷の菊花石[ねおだにのきっかせき]（本巣市根尾）
【国】美濃の壺石[みののつぼいし]（土岐市）
【県】瑞浪の鳴石産地[みずなみのなるいしさんち]（瑞浪市）
【県】笹又の石灰質角礫巨岩[ささまたのせっかいしつかくれききょがん]（揖斐川町春日）
化石
【国】福地の化石産地[ふくぢのかせきさんち]（高山市奥飛騨温泉郷）
【県】明世化石[あけよかせき]（瑞浪市）
【県】牛丸ジュラ紀化石[うしまるじゅらきかせき]（高山市荘川町）
【県】尾上郷ジュラ紀化石[おがみごうじゅらきかせき]（高山市荘川町）
【県】清見層デボン紀化石産地[きよみそうでぼんきかせきさんち]（高山市清見町）
【県】メタセコイア珪化木[めたせこいあけいかぼく]（美濃加茂市）
断層
【国特別天然記念物】根尾谷断層[ねおだにだんそう]（本巣市根尾）
【国】横山楡原衝上断層[よこやまにれはらしょうじょうだんそう]（飛騨市神岡町・富山県）
【県】鏡岩[かがみいわ]（岐阜市）
風化・浸食
【国】鬼岩[おにいわ]（名勝及び天然記念物）（瑞浪市・御嵩町）
【国】傘岩[かさいわ]（恵那市大井町）
【国】飛水峡の甌穴群[ひすいきょうのおうけつぐん]（七宗町）
火山活動
【県】巌立[がんだて]（下呂市小坂町）
標本
【県】浅見化石コレクション[あさみかせきこれくしょん]（岐阜市）
【県】福地化石標本[ふくぢかせきひょうほん]（高山市奥飛騨温泉郷）
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※各文化財の内容等、詳細については市町村の文化財担当部局までお問い合わせください。
